Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NelfeP19426 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms