Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Fgf6-201ENSMUST00000000187 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Ctnnd1-211ENSMUST00000111685 5985 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Ctnnd1-215ENSMUST00000111689 5961 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Rab11b-201ENSMUST00000057373 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Rpl13aP19253 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms