Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pou4f1P17208 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms