Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TtrP07309 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TtrP07309 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TtrP07309 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TtrP07309 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TtrP07309 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TtrP07309 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TtrP07309 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TtrP07309 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TtrP07309 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TtrP07309 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TtrP07309 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TtrP07309 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TtrP07309 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
TtrP07309 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
TtrP07309 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
TtrP07309 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
TtrP07309 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TtrP07309 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TtrP07309 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TtrP07309 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TtrP07309 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TtrP07309 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TtrP07309 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TtrP07309 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TtrP07309 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TtrP07309 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TtrP07309 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
TtrP07309 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TtrP07309 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TtrP07309 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TtrP07309 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TtrP07309 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
TtrP07309 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms