Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc175E9PVB3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms