Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Tlr5Q9JLF7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tlr5Q9JLF7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tlr5Q9JLF7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tlr5Q9JLF7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.8 ms