Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
SrpraQ9DBG7 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms