Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnaseh2cQ9CQ18 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms