Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pacsin3Q99JB8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pacsin3Q99JB8 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pacsin3Q99JB8 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pacsin3Q99JB8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pacsin3Q99JB8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pacsin3Q99JB8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pacsin3Q99JB8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pacsin3Q99JB8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Pacsin3Q99JB8 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Pacsin3Q99JB8 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Pacsin3Q99JB8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Pacsin3Q99JB8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Pacsin3Q99JB8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
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Pacsin3Q99JB8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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