Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LgsnQ8CIX8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
LgsnQ8CIX8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms