Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ufl1Q8CCJ3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms