Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Usp19Q3UJD6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp19Q3UJD6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms