Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc34Q3UI66 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms