Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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HNF4GQ14541 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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HNF4GQ14541 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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HNF4GQ14541 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
HNF4GQ14541 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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