Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp2b3Q0VF55 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp2b3Q0VF55 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp2b3Q0VF55 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp2b3Q0VF55 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp2b3Q0VF55 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp2b3Q0VF55 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp2b3Q0VF55 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp2b3Q0VF55 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp2b3Q0VF55 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp2b3Q0VF55 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp2b3Q0VF55 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atp2b3Q0VF55 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Atp2b3Q0VF55 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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