Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gjb4Q02738 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms