Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Csrnp3P59055 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Csrnp3P59055 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms