Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Hoxb1P17919 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Hoxb1P17919 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Hoxb1P17919 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Hoxb1P17919 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hoxb1P17919 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms