Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COL6A2P12110 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COL6A2P12110 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COL6A2P12110 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms