Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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