Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Chrac1Q9JKP8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Chrac1Q9JKP8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Chrac1Q9JKP8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Chrac1Q9JKP8 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Chrac1Q9JKP8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Chrac1Q9JKP8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Chrac1Q9JKP8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Chrac1Q9JKP8 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Chrac1Q9JKP8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Chrac1Q9JKP8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Chrac1Q9JKP8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Chrac1Q9JKP8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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