Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms