Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MesdQ9ERE7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms