Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Irx6Q9ER75 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx6Q9ER75 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx6Q9ER75 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx6Q9ER75 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Irx6Q9ER75 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx6Q9ER75 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Irx6Q9ER75 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Irx6Q9ER75 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Irx6Q9ER75 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx6Q9ER75 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Irx6Q9ER75 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx6Q9ER75 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx6Q9ER75 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Irx6Q9ER75 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx6Q9ER75 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Irx6Q9ER75 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Irx6Q9ER75 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Irx6Q9ER75 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Irx6Q9ER75 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx6Q9ER75 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Irx6Q9ER75 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms