Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Pdzd9Q9D9M4 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Pdzd9Q9D9M4 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Pdzd9Q9D9M4 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Pdzd9Q9D9M4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Pdzd9Q9D9M4 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Pdzd9Q9D9M4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pdzd9Q9D9M4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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