Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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Tmem54Q9D7S1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tmem54Q9D7S1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tmem54Q9D7S1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tmem54Q9D7S1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tmem54Q9D7S1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Tmem54Q9D7S1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Tmem54Q9D7S1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Tmem54Q9D7S1 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tmem54Q9D7S1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tmem54Q9D7S1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tmem54Q9D7S1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Tmem54Q9D7S1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tmem54Q9D7S1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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