Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GpnmbQ99P91 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms