Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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