Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabp4Q8VHC5 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms