Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab11fip3Q8CHD8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms