Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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