Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Htatsf1Q8BGC0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Htatsf1Q8BGC0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms