Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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Dsg1bQ7TSF1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Dsg1bQ7TSF1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Dsg1bQ7TSF1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
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