Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms