Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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Hes3Q61657 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hes3Q61657 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hes3Q61657 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hes3Q61657 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hes3Q61657 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hes3Q61657 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hes3Q61657 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hes3Q61657 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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