Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
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Ccdc185Q3V118 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Ccdc185Q3V118 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Ccdc185Q3V118 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Ccdc185Q3V118 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ccdc185Q3V118 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Ccdc185Q3V118 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Ccdc185Q3V118 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ccdc185Q3V118 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ccdc185Q3V118 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc185Q3V118 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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