Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
E130208F15RikQ3UPV3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms