Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Col24a1Q30D77 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms