Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gli2Q0VGT2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms