Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms