Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Bop1P97452 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms