Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ccl21cP86793 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccl21cP86793 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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