Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usp46P62069 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usp46P62069 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms