Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl9P51670 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms