Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SrprbP47758 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms