Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Lmo2P25801 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms