Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SftpcP21841 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms