Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnnc2P20801 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms