Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
P18528 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
P18528 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
P18528 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms