Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Hoxb1P17919 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Hoxb1P17919 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxb1P17919 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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